205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3428 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  44.5 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  46.74 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  40.76 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  53.12 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  38.1 
 
 		 328 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  51.89 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  40.74 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  48.94 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  46.08 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  47.47 
 
 		 160 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.23 
 
 		 151 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  45.92 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  44 
 
 		 150 aa  92.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  41.51 
 
 		 145 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  35.76 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  41.26 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  37.82 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  45.36 
 
 		 320 aa  85.9  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  41.18 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  46.6 
 
 		 213 aa  84.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  39.37 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  38.71 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  37.86 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  44.79 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  45.36 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  38.28 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  39.39 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.41 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  42.16 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  39.02 
 
 		 357 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  39.25 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  33.71 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  39.05 
 
 		 342 aa  81.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  39.81 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  37.11 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  44.12 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  44.55 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  42.42 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  38.54 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  36.84 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  43.01 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  40 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  40 
 
 		 307 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  41.24 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  42 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  38.83 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.63 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  39 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  43.14 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  41.76 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  37.04 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  39.58 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  43.14 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  42.72 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  36.73 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  40.21 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0618  hypothetical protein  44.55 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  41 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  42.57 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  38 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  40.62 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  40.66 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  37.62 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  37.37 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  36.89 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  35.35 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  40.78 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  33.56 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  39.56 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  40.38 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  40.4 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  40 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  39.42 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  38 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  40.38 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  37.37 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  37.37 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  37.37 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  37.37 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  34.34 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  35.35 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  35.35 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  35.35 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  35.35 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  35.35 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  35.35 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  38.24 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>