More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0618 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  100 
 
 		 427 aa  875    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  36.55 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.7 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.72 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.45 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  39.45 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.47 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.45 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.47 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  39.45 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.47 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  39.45 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.56 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.45 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  39.45 
 
 		 431 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  36.78 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  39.45 
 
 		 431 aa  265  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  38.28 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  39.21 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.5 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.5 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  37.26 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  36.83 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  36.61 
 
 		 435 aa  255  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.34 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  34.97 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.68 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  36.64 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  36.17 
 
 		 460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  34.14 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.65 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  35.02 
 
 		 452 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.76 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.76 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  31.76 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  32.51 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  32.96 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.31 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  30.65 
 
 		 452 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  31.88 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  32.51 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  35.47 
 
 		 432 aa  194  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.01 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  32.13 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  29.36 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  28.67 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  30.19 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  27.29 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  28.74 
 
 		 482 aa  162  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  28.88 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  28.19 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  32.17 
 
 		 445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.34 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  28.61 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  28.27 
 
 		 468 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  27.27 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  27.98 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  30.12 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  35.11 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  32.23 
 
 		 554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.51 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  34.5 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  32.67 
 
 		 398 aa  136  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  34.02 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  34.15 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  32.96 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  31.73 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  34.48 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  30.24 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  34.48 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  32.95 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  34.43 
 
 		 471 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.58 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  35.69 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  30.53 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  34.38 
 
 		 498 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  31.91 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  33.46 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.56 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  30.16 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.32 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.46 
 
 		 484 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  30.63 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  32.68 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  30.43 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  32.2 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  30.43 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.58 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  32.2 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  29.55 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  32.2 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  30.77 
 
 		 482 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  32.42 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.09 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.44 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  32.45 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  31.82 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.73 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  32.97 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  33.6 
 
 		 505 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>