More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1248 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 326 aa  672    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  55.69 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  46.6 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  44.56 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  40.43 
 
 		 303 aa  242  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  45.42 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  41.86 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  37.67 
 
 		 287 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  40.07 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  41.9 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  40.7 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  36.39 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  42.31 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  40.15 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  39.13 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  35.47 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  38.55 
 
 		 274 aa  175  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  37.85 
 
 		 274 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  37.98 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  37.45 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  38.46 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  34.36 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  39.02 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  38.11 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  45.09 
 
 		 285 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.7 
 
 		 606 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.38 
 
 		 462 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  44.89 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  35.44 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  40.52 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.62 
 
 		 458 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  41.62 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  40.52 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  36.4 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  40.52 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  34.23 
 
 		 458 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  36.78 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  35.55 
 
 		 265 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  44.64 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 462 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  36.88 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  37.97 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 		 256 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  34.48 
 
 		 259 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  34.24 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.17 
 
 		 255 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  31.77 
 
 		 258 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  43.5 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  31.01 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  31.01 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 256 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  31.82 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  32.7 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  32.55 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  34.57 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 		 269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  34.5 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  31.67 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.73 
 
 		 256 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  33.86 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.21 
 
 		 256 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  34.62 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  30.5 
 
 		 457 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  32.18 
 
 		 271 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  34.59 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  34.59 
 
 		 260 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  32.57 
 
 		 255 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 256 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  31.82 
 
 		 256 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  37.22 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1551  Mg-dependent DNase  38.14 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  34.08 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  33.09 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  34.08 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  32.81 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  34.73 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  34.08 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  29.77 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  28.85 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  32.96 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.57 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  30.27 
 
 		 257 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  29.73 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  31.85 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  29.23 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  30.77 
 
 		 258 aa  133  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  32.95 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.12 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  31.8 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.35 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  33.96 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  32.32 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>