208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0506 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0506  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0586  radical SAM family protein  60.29 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1807  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2586  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.66 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  26.42 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  31.69 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.48 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  24.52 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.38 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1786  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1270  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  24.92 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 460 aa  57  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0182  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.796487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.97 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  24.7 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  26.71 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  26.57 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  25 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  26.04 
 
 		 491 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 565 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 503 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.11 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  29.93 
 
 		 487 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 482 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  28.98 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.89 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.14 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  27.38 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.67 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  28.47 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  28.47 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1935  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.100874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  26.01 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  28.67 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  28.29 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  28.29 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>