More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1938 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 388 aa  762    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  59.11 
 
 		 386 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  41.34 
 
 		 392 aa  256  6e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 385 aa  245  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 		 496 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 		 500 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 500 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 381 aa  235  9e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  42.13 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  30.59 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 806 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 799 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 819 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 805 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 823 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  31.76 
 
 		 445 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 806 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 806 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 816 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 816 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 802 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 843 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 797 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 815 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  31.17 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 817 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  33.76 
 
 		 822 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 801 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 394 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 804 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 455 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 443 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 444 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 444 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 372 aa  135  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 398 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 398 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 825 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.79 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 826 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  30.05 
 
 		 831 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  28.64 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 815 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 815 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 831 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 827 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 812 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 816 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 413 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>