75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0963 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  48.33 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  46.67 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.47 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  36.76 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  38.6 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  31.9 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.21 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  35.82 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  28.57 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  39.34 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  31.51 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  32.86 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  38.6 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  34.92 
 
 		 446 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  34.92 
 
 		 438 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.05 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  38.6 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  38.6 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  34.29 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3430  hypothetical protein  32.11 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  34.67 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  36 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  29.66 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  30.33 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  47.17 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  30.28 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  33.72 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  38.71 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  24.67 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  63.33 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  36.11 
 
 		 70 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  39.68 
 
 		 145 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5000  hypothetical protein  30.67 
 
 		 215 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  50 
 
 		 141 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  40.98 
 
 		 174 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  39.68 
 
 		 145 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  31.2 
 
 		 142 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  48.78 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0646  hypothetical protein  35.37 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.03 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.18 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  30 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  31.08 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  32.94 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.73 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  35 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0651  methylation site containing protein  34.38 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  36.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3435  hypothetical protein  31.52 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.52 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.68 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  37.93 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  37.93 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  37.93 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  37.93 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.37 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  37.93 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  37.93 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  37.93 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.71 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  62.07 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  35 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  26.8 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  34.43 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.45 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.59 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  31.82 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>