More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3670 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.14 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.81 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  62.86 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  59.29 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.22 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.43 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.39 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  48.18 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  48.59 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  46.04 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  49.25 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  45.14 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  47.06 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  51.97 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  45.99 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.1 
 
 		 170 aa  124  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  44.2 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  46.46 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  38.46 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  43.48 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  61.76 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  41.73 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  51.18 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.74 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.09 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.97 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.75 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  52.7 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  47.87 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.33 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.33 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.35 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.33 
 
 		 288 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  45.83 
 
 		 259 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.56 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3562  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  51.95 
 
 		 236 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  48.68 
 
 		 292 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.52 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  50 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  50 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  40.19 
 
 		 240 aa  70.1  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.52 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  47.06 
 
 		 257 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.33 
 
 		 366 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 		 266 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 		 235 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  47.44 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  51.35 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  48.72 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  46.34 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  44 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.39 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  46.34 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.88 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.57 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  48.72 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  48.57 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  45 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.52 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.28 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  43.75 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.75 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  44.55 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.32 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  46.75 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.71 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  47.37 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  52.17 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  43.75 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  52.17 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  52.17 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.32 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  52.17 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.62 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  44.32 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  50.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  52.17 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  48.57 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  48.75 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 		 400 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.5 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.4 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>