More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3562 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3562  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  37.14 
 
 		 336 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  38.31 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.21 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 		 303 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  37.24 
 
 		 253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 		 246 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.7 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.88 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.81 
 
 		 301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.21 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.63 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 		 311 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  37.81 
 
 		 301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.71 
 
 		 301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.71 
 
 		 303 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.71 
 
 		 303 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.35 
 
 		 247 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.38 
 
 		 238 aa  111  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  35.38 
 
 		 307 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.05 
 
 		 262 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.21 
 
 		 307 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  36.23 
 
 		 304 aa  111  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 		 250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.36 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.85 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.85 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.62 
 
 		 238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.32 
 
 		 242 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  34.95 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  39.04 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.42 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  37.62 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.1 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.24 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.69 
 
 		 304 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  34.1 
 
 		 242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.32 
 
 		 309 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.64 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1905  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.42 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.339028  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.52 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.77 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.87 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.371589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  37.16 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  37.16 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  37.76 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.48 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.92 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  34.63 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.47 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.46 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.46 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.92 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.06 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.46 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.89 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.3 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.43 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  36.61 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.9 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.32 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.92 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  34.51 
 
 		 316 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.92 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.92 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.92 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 		 286 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  36.65 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  46.72 
 
 		 239 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  46.72 
 
 		 239 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.08 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 		 296 aa  104  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  35.19 
 
 		 265 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.96 
 
 		 301 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.75 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  33.01 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.27 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.06 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.41 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.01 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  35.35 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.06 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  37.11 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  37.11 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.96 
 
 		 288 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.68 
 
 		 366 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  35.32 
 
 		 341 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>