More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2707 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 328 aa  627  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  38.98 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  40.89 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  41.58 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  39.18 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  39.25 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  41.24 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  40.69 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  40.67 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  34.52 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  34.19 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  39.19 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  40.21 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  40.89 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  40.69 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  32.19 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  37.33 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  35.29 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  34.24 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  34.64 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  35.54 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  30.94 
 
 		 266 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  31.14 
 
 		 267 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  31.51 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  36.86 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  37.41 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  32.31 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  28.03 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  42.4 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.45 
 
 		 354 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  32.01 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  32.01 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  32.68 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  38.83 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  34.21 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  30.72 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  31.27 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  35.02 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  30.67 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  31.72 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  31.72 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  31.72 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  31.72 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  31.72 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  31.6 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  33.75 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  32.67 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  30.86 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  30.86 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  33.23 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.04 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  30.14 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.48 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  30.38 
 
 		 354 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  31.42 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  27.8 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  30.15 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.5 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  33.9 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  31.29 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  31.29 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  31.29 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  31.29 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  31.29 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  31.29 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  31.29 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  21.45 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  31.76 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  36.55 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  31.58 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  33.6 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  30.7 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  30.97 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  29.18 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  25.23 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  25.76 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.03 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  32.8 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  27.62 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  28.62 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  28.95 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  30.26 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  29.04 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  25.78 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  31.6 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  31.93 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  25.87 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>