95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2629 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
417 aa  843    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  55.91 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.67 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.34 
 
 
419 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.5 
 
 
408 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  52.44 
 
 
416 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.28 
 
 
417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.92 
 
 
413 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.92 
 
 
413 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.93 
 
 
413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.18 
 
 
413 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.18 
 
 
413 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.18 
 
 
413 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.93 
 
 
413 aa  339  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.68 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.68 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  42.68 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  42.68 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.6 
 
 
417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.41 
 
 
425 aa  329  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.16 
 
 
416 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.65 
 
 
425 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.26 
 
 
427 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.74 
 
 
404 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  45.76 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.96 
 
 
410 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  45.59 
 
 
634 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  44.04 
 
 
415 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  40.4 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.44 
 
 
424 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.12 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  41.56 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.28 
 
 
418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.95 
 
 
418 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.9 
 
 
391 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  37.99 
 
 
418 aa  242  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.23 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.03 
 
 
419 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.5 
 
 
418 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.23 
 
 
419 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.38 
 
 
403 aa  187  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.99 
 
 
398 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.97 
 
 
406 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.14 
 
 
392 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.87 
 
 
420 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.77 
 
 
389 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.09 
 
 
401 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  30.75 
 
 
427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.56 
 
 
427 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.61 
 
 
426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.61 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.55 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.61 
 
 
426 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.06 
 
 
426 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.17 
 
 
411 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.56 
 
 
408 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.79 
 
 
426 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.61 
 
 
426 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.76 
 
 
401 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  31.69 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.06 
 
 
394 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  29.61 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.9 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  30.89 
 
 
470 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  29.35 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  33.44 
 
 
944 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.23 
 
 
489 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  32.23 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.23 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  32.23 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  32.23 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.23 
 
 
500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.23 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.09 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.69 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.86 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.1 
 
 
419 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.26 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  25.94 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.47 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.84 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.84 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.79 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  26.72 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  28 
 
 
386 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.98 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.72 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.49 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  23.26 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.64 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.57 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.64 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  24.12 
 
 
374 aa  43.1  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>