67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1763 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  100 
 
 
172 aa  342  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  65.68 
 
 
174 aa  225  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  69.91 
 
 
125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  41.27 
 
 
180 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  35.46 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  36.69 
 
 
181 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  34.84 
 
 
178 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  35.26 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  34.78 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  35.86 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  29.88 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  31.74 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  33.1 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  35.71 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  28.67 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  32.74 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  31.72 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  34.87 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  30.14 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  32.67 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  32.37 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  36.36 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  24.64 
 
 
157 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  31.79 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  30.3 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  32.35 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  33.14 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  39.81 
 
 
189 aa  57.8  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  32.35 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  36.67 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  28.47 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  30.54 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  34.25 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  35.25 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  35.25 
 
 
146 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.34 
 
 
139 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  35.34 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  32.41 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  33.13 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  32.21 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  31.29 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  37.17 
 
 
144 aa  48.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  33.61 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  31.67 
 
 
170 aa  47.8  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  31.58 
 
 
160 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  34.55 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  33.62 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  25.32 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  34.19 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  32.76 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  26.09 
 
 
149 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  31.25 
 
 
114 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  31.01 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  35.61 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  36.46 
 
 
135 aa  44.3  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  28.67 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  27.59 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  29.86 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  33.81 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  30.4 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  29.52 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  33.54 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.84 
 
 
137 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  34.55 
 
 
132 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  34.55 
 
 
132 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>