More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2103 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  100 
 
 		 174 aa  340  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  57.86 
 
 		 169 aa  160  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  57.25 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  51.52 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  55.41 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  51.57 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  51.57 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  51.57 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  49.7 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  50.94 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  59.06 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  52.17 
 
 		 214 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  54.42 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  53.79 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  51.79 
 
 		 331 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  41.77 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  52.9 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  43.79 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  48.57 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  50.41 
 
 		 291 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  55.36 
 
 		 223 aa  104  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  49.32 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.65 
 
 		 238 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  42.34 
 
 		 195 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  48.2 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  41.45 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  47.45 
 
 		 362 aa  94  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  47.52 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  47.15 
 
 		 254 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  36.84 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  44.62 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  35.94 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.57 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  31.55 
 
 		 491 aa  61.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  33.62 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  37.23 
 
 		 445 aa  54.7  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  29.31 
 
 		 395 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  39 
 
 		 459 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  37.01 
 
 		 293 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  33.85 
 
 		 447 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  33.85 
 
 		 447 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  38.53 
 
 		 597 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  39.81 
 
 		 695 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  40.37 
 
 		 592 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  34.62 
 
 		 446 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  34.69 
 
 		 498 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  37.37 
 
 		 367 aa  51.2  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  37.16 
 
 		 318 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  31.91 
 
 		 288 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  36.67 
 
 		 373 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.23 
 
 		 321 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34.95 
 
 		 446 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  36.49 
 
 		 321 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  36.49 
 
 		 319 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  36.17 
 
 		 452 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.26 
 
 		 293 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  36.73 
 
 		 439 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  38.1 
 
 		 287 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  29.5 
 
 		 307 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  35.65 
 
 		 441 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  29.25 
 
 		 272 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  33.65 
 
 		 376 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  34 
 
 		 299 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.66 
 
 		 464 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  35.78 
 
 		 453 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  34.86 
 
 		 360 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  34.86 
 
 		 360 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.78 
 
 		 425 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  35.05 
 
 		 409 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  38.46 
 
 		 457 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  34.86 
 
 		 360 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  33.66 
 
 		 292 aa  48.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.78 
 
 		 425 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  37.93 
 
 		 450 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  37.93 
 
 		 345 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.67 
 
 		 274 aa  47.8  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.91 
 
 		 379 aa  47.8  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  35.16 
 
 		 464 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  38.46 
 
 		 457 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  38.46 
 
 		 457 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  29.71 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0690  hypothetical protein  30.2 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  33.33 
 
 		 491 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  31.78 
 
 		 315 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  32.97 
 
 		 300 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  35.56 
 
 		 302 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  34.29 
 
 		 431 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  36.79 
 
 		 389 aa  47.4  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  35.92 
 
 		 253 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  38.95 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  36.08 
 
 		 441 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  39.47 
 
 		 754 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  32.29 
 
 		 373 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  38.89 
 
 		 260 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.53 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  33.65 
 
 		 541 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  35.87 
 
 		 441 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  29 
 
 		 388 aa  46.6  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  33.9 
 
 		 420 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  38 
 
 		 468 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>