134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1917 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  51.63 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  51.63 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  51.63 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  50.33 
 
 
171 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  46.41 
 
 
166 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  48.03 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.37 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  35 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  35.03 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.46 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  33.57 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.41 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  33.75 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.91 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.25 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  34.67 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  31.41 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  31.51 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
193 aa  60.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  30.28 
 
 
194 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  27.92 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  23.24 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  23.24 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  31.61 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  32.89 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 
189 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.13 
 
 
192 aa  54.3  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  30.72 
 
 
181 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  26 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.8 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.8 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  26.35 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  26 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.15 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.26 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  25.9 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  30.86 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.9 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.06 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  26 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
443 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
443 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
443 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  24.82 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 
174 aa  51.2  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.68 
 
 
168 aa  50.8  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 
175 aa  50.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.76 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  36.43 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  30.5 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  24.67 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.35 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.34 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.31 
 
 
203 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  35.42 
 
 
448 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  35.11 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  27.34 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.06 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  26.03 
 
 
191 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  27.66 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  26.17 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  31.97 
 
 
156 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  26.92 
 
 
264 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.3 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1017  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000143879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  35.92 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.14 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  28.06 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  26.17 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  28.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  28.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  25.35 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  25.5 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  29.29 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>