258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0349 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0349  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 599 aa  1183    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0356  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.07 
 
 		 603 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4102  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.14 
 
 		 761 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.75 
 
 		 1473 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0422166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  24.95 
 
 		 1715 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  25.33 
 
 		 1050 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 685 aa  61.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.26 
 
 		 1469 aa  60.1  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 1027 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  37.36 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1890  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.72 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  31.46 
 
 		 1066 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.75 
 
 		 794 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  35.56 
 
 		 685 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  28.4 
 
 		 1707 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3192  UvrD/REP helicase  38.67 
 
 		 615 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1119  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.42 
 
 		 691 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_51012  protein required for proper timing of committment to meiotic recombination and the transition from Meiosis I to Meiosis II  29.86 
 
 		 908 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.875639  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1244  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.42 
 
 		 691 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.56 
 
 		 849 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0621  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.42 
 
 		 691 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  42.42 
 
 		 689 aa  52.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  45.59 
 
 		 1120 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.91 
 
 		 689 aa  52.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  39.78 
 
 		 659 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  20.81 
 
 		 738 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  41.89 
 
 		 759 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 685 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  34.78 
 
 		 1041 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  34.55 
 
 		 646 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  34.48 
 
 		 687 aa  51.6  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  28.91 
 
 		 712 aa  51.2  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.48 
 
 		 711 aa  51.6  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  39.36 
 
 		 726 aa  50.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  26.2 
 
 		 688 aa  51.2  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 708 aa  50.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  31.91 
 
 		 731 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  26.55 
 
 		 401 aa  50.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 1161 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  34.83 
 
 		 1032 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1347  rep helicase, single-stranded DNA-dependent ATPase protein  38.81 
 
 		 154 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  36.26 
 
 		 666 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  33.04 
 
 		 1089 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  29.06 
 
 		 1244 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  32.12 
 
 		 1060 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.83 
 
 		 741 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.67 
 
 		 662 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  39.13 
 
 		 724 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  41.18 
 
 		 721 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.88 
 
 		 665 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  41.18 
 
 		 721 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.88 
 
 		 665 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  40.85 
 
 		 743 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.86 
 
 		 796 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  27.75 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  33.01 
 
 		 1106 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  28.57 
 
 		 698 aa  49.3  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  32.58 
 
 		 736 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  34.04 
 
 		 688 aa  49.7  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.67 
 
 		 694 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.47 
 
 		 671 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4251  UvrD/REP helicase  37.89 
 
 		 715 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  36.71 
 
 		 723 aa  48.9  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  26.55 
 
 		 388 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  34.44 
 
 		 668 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.33 
 
 		 690 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.46 
 
 		 739 aa  48.9  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  33.8 
 
 		 978 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 876 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  34.52 
 
 		 726 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  41.1 
 
 		 684 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  41.1 
 
 		 684 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 		 697 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  34.78 
 
 		 723 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  41.1 
 
 		 684 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3746  UvrD/REP helicase  52.17 
 
 		 730 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.78 
 
 		 699 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  41.1 
 
 		 684 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.5 
 
 		 682 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  26.48 
 
 		 486 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  32.37 
 
 		 1144 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  26.48 
 
 		 486 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  35.79 
 
 		 773 aa  48.5  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  32.61 
 
 		 630 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  32.61 
 
 		 723 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  25.17 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 742 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 706 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  31.11 
 
 		 735 aa  48.1  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 735 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  37.76 
 
 		 634 aa  47.8  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  23.85 
 
 		 552 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.79 
 
 		 798 aa  47.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 733 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  28.1 
 
 		 500 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  42.65 
 
 		 728 aa  47.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  41.1 
 
 		 684 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  39.13 
 
 		 724 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  32.22 
 
 		 783 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>