More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0167 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  40.89 
 
 		 1078 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  39.24 
 
 		 1082 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  51.94 
 
 		 1032 aa  1025    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1161 aa  2303    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  51.81 
 
 		 1050 aa  994    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  42.6 
 
 		 1132 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  48.37 
 
 		 1062 aa  902    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  41.7 
 
 		 1075 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  51.76 
 
 		 1089 aa  984    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  47.88 
 
 		 1124 aa  915    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  48.12 
 
 		 1067 aa  871    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  49.96 
 
 		 1001 aa  954    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  46.75 
 
 		 1156 aa  892    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  41.38 
 
 		 1232 aa  628  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.87 
 
 		 1089 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  37.45 
 
 		 1033 aa  611  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  36.98 
 
 		 1027 aa  598  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  37.91 
 
 		 1127 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  36.54 
 
 		 1174 aa  572  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  59.62 
 
 		 428 aa  505  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  52.02 
 
 		 414 aa  463  9.999999999999999e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  53.07 
 
 		 1244 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  55.48 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  52.05 
 
 		 408 aa  443  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  48.67 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  47.94 
 
 		 411 aa  383  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  42.89 
 
 		 414 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.65 
 
 		 715 aa  293  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.45 
 
 		 759 aa  285  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.63 
 
 		 758 aa  283  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  33.62 
 
 		 706 aa  279  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  27.29 
 
 		 735 aa  277  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  32.08 
 
 		 737 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.15 
 
 		 768 aa  271  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.32 
 
 		 829 aa  270  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 726 aa  269  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  31.4 
 
 		 678 aa  266  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.28 
 
 		 763 aa  263  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.08 
 
 		 831 aa  261  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.03 
 
 		 732 aa  261  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.38 
 
 		 718 aa  261  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.21 
 
 		 741 aa  261  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  32.28 
 
 		 762 aa  260  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.93 
 
 		 741 aa  258  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  29 
 
 		 749 aa  257  9e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.97 
 
 		 729 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  34.22 
 
 		 671 aa  257  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.22 
 
 		 671 aa  255  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  29.55 
 
 		 770 aa  255  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  34.07 
 
 		 671 aa  255  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.21 
 
 		 772 aa  254  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.98 
 
 		 753 aa  253  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.97 
 
 		 690 aa  253  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.06 
 
 		 784 aa  252  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.64 
 
 		 851 aa  252  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.84 
 
 		 753 aa  251  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  29.02 
 
 		 753 aa  251  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.02 
 
 		 751 aa  251  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.02 
 
 		 747 aa  251  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.52 
 
 		 858 aa  251  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.73 
 
 		 751 aa  251  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  29.02 
 
 		 751 aa  251  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.69 
 
 		 747 aa  251  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.42 
 
 		 742 aa  250  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.5 
 
 		 694 aa  250  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.21 
 
 		 773 aa  250  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.13 
 
 		 762 aa  250  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  32.96 
 
 		 726 aa  249  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.39 
 
 		 785 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 678 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.39 
 
 		 785 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  30.89 
 
 		 722 aa  249  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  30.89 
 
 		 722 aa  249  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  30.07 
 
 		 721 aa  249  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  30.03 
 
 		 722 aa  248  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.88 
 
 		 751 aa  248  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.88 
 
 		 747 aa  248  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  33.43 
 
 		 725 aa  248  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  30.41 
 
 		 735 aa  248  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  30.47 
 
 		 722 aa  248  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  30.47 
 
 		 722 aa  248  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.01 
 
 		 765 aa  248  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  30.46 
 
 		 727 aa  248  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  30.47 
 
 		 722 aa  248  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  30.47 
 
 		 722 aa  247  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.31 
 
 		 741 aa  247  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  30.75 
 
 		 722 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  31.63 
 
 		 729 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  29.6 
 
 		 722 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  27.79 
 
 		 724 aa  244  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.47 
 
 		 785 aa  244  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.48 
 
 		 757 aa  242  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  30.34 
 
 		 736 aa  241  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  30.97 
 
 		 735 aa  241  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32 
 
 		 838 aa  241  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  31.1 
 
 		 731 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.43 
 
 		 858 aa  239  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  34.08 
 
 		 659 aa  239  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.09 
 
 		 802 aa  239  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.27 
 
 		 756 aa  238  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>