More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3119 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  98.19 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  81.45 
 
 		 279 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  77.86 
 
 		 272 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  76.3 
 
 		 271 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  41.77 
 
 		 270 aa  208  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  44.63 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  44.49 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  39.53 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  43.57 
 
 		 248 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  41 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  40.71 
 
 		 260 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 		 248 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40.74 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  40.74 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  40.74 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  40.91 
 
 		 248 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.91 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  39.92 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  40.33 
 
 		 361 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  40.33 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  38.98 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  42.67 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  40.51 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  39.92 
 
 		 260 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  41.98 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  42.21 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  40.33 
 
 		 361 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  40.33 
 
 		 361 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.02 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  39.92 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  40.76 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  39.67 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  40.23 
 
 		 261 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 397 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  36.78 
 
 		 279 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  37.25 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  39.92 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  41.15 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.33 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  44.49 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  38.27 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  38.68 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  41.7 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 242 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  40.44 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  44.3 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  39.09 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.84 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41.46 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  39.17 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  40.55 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  40.55 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  40.76 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  40.76 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  39.51 
 
 		 359 aa  168  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  42.29 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 421 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  39.76 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  40.98 
 
 		 251 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2120  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  41.89 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  41.92 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  40.08 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  41.32 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  41.42 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  39.51 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  43.11 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  40.91 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  41.92 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  39.24 
 
 		 259 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  39.83 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  37.6 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  39.17 
 
 		 363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  39.82 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.41 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  40.91 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  39.75 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  39.24 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>