More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2385 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  83.33 
 
 		 156 aa  281  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  45.03 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  45.03 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  43.59 
 
 		 266 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  44.16 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  43.59 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  43.23 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  40.62 
 
 		 300 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  39.62 
 
 		 262 aa  130  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  39.88 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 		 195 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  37.01 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  37.01 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  37.01 
 
 		 185 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  35.71 
 
 		 190 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  35.71 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  39.16 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  34.59 
 
 		 177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  38.31 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  38.16 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  36.3 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  33.12 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  38.41 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  33.55 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  44.19 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  44.16 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  42.11 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  28.1 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  40.26 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  42.31 
 
 		 256 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  29.56 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  36.71 
 
 		 124 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  40.85 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  37.97 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.69 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 330 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.03 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.43 
 
 		 311 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.03 
 
 		 350 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.03 
 
 		 350 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  31.58 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.67 
 
 		 316 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  29.2 
 
 		 663 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 321 aa  63.5  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 244 aa  63.9  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  39.74 
 
 		 367 aa  63.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  24 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  47.06 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  32.84 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  37.84 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  32.84 
 
 		 434 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  38.89 
 
 		 342 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  44.44 
 
 		 375 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 405 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 		 302 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  41.43 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  39.47 
 
 		 426 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  37.66 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  38.46 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  39.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 377 aa  60.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  40.74 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  37.33 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  38.16 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  37.97 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  25.58 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  41.43 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  40.85 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  40.85 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  32.67 
 
 		 620 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  36 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  41.43 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  34.65 
 
 		 646 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  41.43 
 
 		 375 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  31.09 
 
 		 649 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  32.67 
 
 		 620 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  33.66 
 
 		 644 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  31.62 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  41.43 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  31.09 
 
 		 649 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  41.43 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 362 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  31.09 
 
 		 646 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  33.93 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 362 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  32.32 
 
 		 647 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 362 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  32.67 
 
 		 620 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  37.33 
 
 		 352 aa  57.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  34.34 
 
 		 650 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  37.5 
 
 		 336 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  39.44 
 
 		 370 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>