234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2010 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
142 aa  289  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  69.06 
 
 
140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  43.51 
 
 
134 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  40.98 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  43.59 
 
 
184 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  52.7 
 
 
226 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  43.09 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  47.44 
 
 
265 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  39.2 
 
 
323 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  50.65 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  46.91 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  50.7 
 
 
284 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  37.29 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  39.6 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  45.56 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  38.02 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  61.4 
 
 
285 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  45.45 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  37.82 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  44.74 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  63.46 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  46.25 
 
 
225 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  37.8 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  36.78 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  40.2 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  39.58 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  36.25 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  49.3 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  52.73 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  38.75 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  39.24 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  39.25 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  40.24 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  34.68 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  34.95 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  38.37 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  34.68 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  38.96 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  39.44 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  35.24 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  42.86 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  40 
 
 
263 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  32.11 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  36.84 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  33.03 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  32.11 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  34.58 
 
 
233 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  47.76 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  39.51 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  33.33 
 
 
238 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  35.58 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  32.69 
 
 
222 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  36.63 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  40.54 
 
 
221 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  39.19 
 
 
233 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  31.68 
 
 
225 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 
224 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  33.06 
 
 
224 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  35.66 
 
 
185 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  38.03 
 
 
221 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  33.06 
 
 
224 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
225 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  38.03 
 
 
223 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  38.24 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  41.38 
 
 
175 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  31.46 
 
 
221 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  31.46 
 
 
221 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  43.94 
 
 
223 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  43.94 
 
 
223 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  32.14 
 
 
228 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  31.68 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  29.82 
 
 
227 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  37.68 
 
 
218 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  37.18 
 
 
218 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  31.25 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  31.37 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1623  flagellar basal body rod modification protein  44.78 
 
 
221 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  34.43 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  25.78 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  37.68 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  35.9 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.9 
 
 
245 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  46.81 
 
 
230 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  34.74 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  36.84 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  29.03 
 
 
218 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  30.67 
 
 
226 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  31.71 
 
 
226 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  30.1 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  34.09 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  31.65 
 
 
228 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
226 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>