111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0105 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  94.39 
 
 		 624 aa  1163    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 624 aa  1265    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  53.6 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  52.61 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  46.51 
 
 		 466 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  46.53 
 
 		 593 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  47.95 
 
 		 451 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  45.91 
 
 		 456 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  49.88 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  45.48 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  45.19 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  46.29 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  46.47 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  50.36 
 
 		 482 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  37.5 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  47.63 
 
 		 476 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  49.49 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  46.22 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  45.64 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  49.22 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  49.22 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  48.02 
 
 		 472 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  48.96 
 
 		 478 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  47.09 
 
 		 451 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  46.26 
 
 		 476 aa  361  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  44.9 
 
 		 466 aa  360  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  45.12 
 
 		 477 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  43.34 
 
 		 486 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  42.99 
 
 		 454 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  39.73 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  39.5 
 
 		 456 aa  323  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  43.89 
 
 		 445 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  39.69 
 
 		 461 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  41.69 
 
 		 454 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  42.68 
 
 		 451 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  37.53 
 
 		 452 aa  301  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  39.6 
 
 		 448 aa  300  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  38.5 
 
 		 456 aa  276  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  38.39 
 
 		 448 aa  273  9e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  30.56 
 
 		 674 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  24.24 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  26.27 
 
 		 393 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.86 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  25.28 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  25.6 
 
 		 406 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  26.98 
 
 		 416 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  26 
 
 		 453 aa  97.8  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  27.55 
 
 		 388 aa  96.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  26.14 
 
 		 389 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  24.71 
 
 		 384 aa  95.9  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  25.99 
 
 		 416 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  25.43 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  23.81 
 
 		 389 aa  93.2  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  26.41 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 416 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  28.02 
 
 		 442 aa  90.9  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  26.25 
 
 		 413 aa  90.5  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  25.91 
 
 		 414 aa  89.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  24.17 
 
 		 666 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  25.86 
 
 		 469 aa  86.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  25.63 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  23.38 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  26.46 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  25.37 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  24.84 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  31.4 
 
 		 180 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.99 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  24.65 
 
 		 383 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  25.19 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  25 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  30.72 
 
 		 181 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  24.62 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  23.35 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  25.66 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.81 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  23.91 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  25.32 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  23.69 
 
 		 384 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  29.94 
 
 		 172 aa  62  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  29.94 
 
 		 172 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  31.85 
 
 		 175 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2774  hypothetical protein  33.81 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  30.71 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  23.2 
 
 		 389 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  29.14 
 
 		 174 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  31.21 
 
 		 181 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  29.84 
 
 		 192 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  29.84 
 
 		 192 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  31.13 
 
 		 175 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  24.3 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  27.74 
 
 		 172 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  25.08 
 
 		 397 aa  51.6  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  27.08 
 
 		 386 aa  50.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  29.11 
 
 		 179 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  22.62 
 
 		 197 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  22.8 
 
 		 389 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  23.49 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  28 
 
 		 217 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  26.98 
 
 		 180 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  22.76 
 
 		 391 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>