163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0481 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 413 aa  808    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  61.08 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  51.71 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  54.71 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  53.61 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  49.87 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  50.13 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  46.65 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  45.31 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  34.67 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  35.58 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  34.15 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  30.46 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  27.49 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  30.2 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  28.65 
 
 		 384 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  28.75 
 
 		 383 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  29.09 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  28.78 
 
 		 385 aa  151  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  28.5 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  29.43 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  28.76 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  29.47 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  28.53 
 
 		 417 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  26.38 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  30.91 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  31.67 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  29.26 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  28.93 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  28.72 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  28.61 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  27.09 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  29.64 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  28.03 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  31.53 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  27.5 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  25.95 
 
 		 624 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  27.54 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  27.22 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  28.01 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  27.87 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  25.41 
 
 		 624 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  25.5 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 		 430 aa  99.8  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  27.38 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  29.11 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  27.48 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  23.98 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  29.22 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  24.32 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  24.93 
 
 		 603 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  22.36 
 
 		 593 aa  90.5  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  24.32 
 
 		 454 aa  90.1  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  23.95 
 
 		 445 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  22.5 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  23.73 
 
 		 484 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  21.75 
 
 		 466 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  25.81 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  25.88 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  25.72 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  23.56 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  26.64 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  24.35 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  23.86 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  22.13 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  23.51 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.61 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  25.06 
 
 		 483 aa  76.3  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  25.28 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  22.63 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  23.54 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  22.17 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  24.43 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.37 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  22.83 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  23.18 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  25.14 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  24.04 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  28.87 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  22.02 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  20.88 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  24.87 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  24.15 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  22.02 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  23.04 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  22.65 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  23.39 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  24.29 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  26.22 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  22.12 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  23.1 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  24.27 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  22.05 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  22.05 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  21.37 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  23.87 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  21.76 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  23.02 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  22.64 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  22.48 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>