47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0524 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  811    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  39.66 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  36.47 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  39.78 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  35.03 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  38.81 
 
 		 455 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  36.68 
 
 		 464 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  32.79 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  31.71 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  33.25 
 
 		 409 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  29.25 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  29.25 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  28.96 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  29.71 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  28.79 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  24.75 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  39.63 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  24.04 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  25.38 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  26.17 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  27.38 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  27.94 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  26.42 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  31.52 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  27.55 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  23.26 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.62 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  22.13 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  22.02 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  19.9 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  19.9 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  19.9 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  23.73 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  23.38 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  30.77 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  23.98 
 
 		 352 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  22.45 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  23.61 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  24.31 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  24.44 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  20.41 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  27.54 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  25.9 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  22.14 
 
 		 493 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  24.46 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>