31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3930 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  849    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  37.74 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  38.22 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  38.22 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  35.03 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  35.35 
 
 		 394 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  33.92 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  31.24 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  32.08 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  30.53 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  30.67 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  28.04 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  29.23 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  28.65 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  25.88 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  28.84 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  34.9 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  28.24 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  28.8 
 
 		 455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  26.89 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  27.93 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  26.91 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  29.81 
 
 		 304 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  27.73 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  24.66 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  30.37 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  23.91 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  23.87 
 
 		 352 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  24.71 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  23.6 
 
 		 358 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  25.23 
 
 		 353 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>