43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3382 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  833    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  37.28 
 
 
414 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  36.27 
 
 
414 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  35.25 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  37.53 
 
 
398 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  33.74 
 
 
392 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  33.17 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  33.76 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  33.06 
 
 
417 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  33.01 
 
 
409 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  34.02 
 
 
394 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  33.53 
 
 
394 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  30.89 
 
 
400 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  26.52 
 
 
458 aa  132  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  28.74 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  27.95 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  25.56 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  26.12 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  31.71 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  30.65 
 
 
304 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  24.04 
 
 
402 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  25.83 
 
 
470 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  30.59 
 
 
344 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  25 
 
 
345 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  22.43 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  22.74 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  24.46 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  25.11 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  23.1 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  22.15 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  26.06 
 
 
253 aa  63.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  25.63 
 
 
352 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  24.17 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  25 
 
 
358 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  21.04 
 
 
348 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  22.91 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  23.27 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  20.13 
 
 
472 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.07 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  23.71 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  23.71 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>