39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6227 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  68.85 
 
 
318 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  67.91 
 
 
318 aa  346  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  73.02 
 
 
318 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  58.06 
 
 
319 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  60.71 
 
 
329 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  53.58 
 
 
348 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  37.62 
 
 
344 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  37.5 
 
 
304 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  26.6 
 
 
392 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  27.81 
 
 
398 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  25.71 
 
 
413 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  31.37 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  26.42 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  27.16 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  23.51 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  26.75 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  25.17 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  23.45 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  24.5 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  24.16 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  29.35 
 
 
352 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  22.32 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  22.54 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  29.76 
 
 
358 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  29.69 
 
 
358 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  26.7 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  26.29 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  22.13 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  22.71 
 
 
470 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  22.33 
 
 
458 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  29.13 
 
 
454 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  31.5 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  19.37 
 
 
464 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4460  hypothetical protein  31.88 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4924  hypothetical protein  31.4 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0637585  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  23.86 
 
 
422 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  27.38 
 
 
482 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  25.99 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>