45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2999 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  796    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  35.99 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  38.83 
 
 
413 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  37.53 
 
 
411 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  35.92 
 
 
414 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  35.66 
 
 
414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  36.16 
 
 
394 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  35.88 
 
 
394 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  35.31 
 
 
394 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  33.78 
 
 
394 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  33.7 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  32.92 
 
 
409 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  31.69 
 
 
417 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  28.15 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  28.57 
 
 
400 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  29.63 
 
 
304 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  25.88 
 
 
458 aa  113  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  31.11 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  26.15 
 
 
464 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  26.57 
 
 
436 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  27.11 
 
 
470 aa  99.8  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  29.05 
 
 
455 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  27.94 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  25.89 
 
 
329 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  24.16 
 
 
319 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  25.4 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  26.82 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  22.36 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  24.76 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  26.91 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  28.51 
 
 
346 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  26.89 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  26.64 
 
 
253 aa  77  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  26.79 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  25.5 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  25.55 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  27.06 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  25.3 
 
 
352 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  29.06 
 
 
353 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  22.88 
 
 
410 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  20.78 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  26.02 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.16 
 
 
456 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  24.29 
 
 
493 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  26.23 
 
 
482 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>