109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2775 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  80.54 
 
 		 456 aa  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 472 aa  950    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  45.69 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  44.7 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  45.19 
 
 		 624 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  39.91 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  44.6 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  44.11 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  42.02 
 
 		 478 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  42.63 
 
 		 482 aa  329  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  39.75 
 
 		 466 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  41.18 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  41.18 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  41.76 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  40.62 
 
 		 593 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  41.53 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  40.91 
 
 		 466 aa  322  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  40.18 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  42.03 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  41.69 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  41.08 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  38.08 
 
 		 490 aa  316  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  39.86 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  39.74 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  39.3 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  42.12 
 
 		 452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  42.36 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  38.5 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  42.36 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  42.39 
 
 		 603 aa  310  5e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  43.11 
 
 		 451 aa  308  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  37.9 
 
 		 451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  38.88 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  39.91 
 
 		 477 aa  302  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  39.29 
 
 		 476 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  38.64 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  37.89 
 
 		 456 aa  280  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  37.3 
 
 		 448 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  37.32 
 
 		 448 aa  263  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  30.71 
 
 		 674 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  27.27 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.91 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  27.59 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  27.64 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  26.13 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  26.27 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  24.36 
 
 		 411 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  27.11 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.36 
 
 		 414 aa  93.6  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  25.42 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  25.89 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  28.12 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  25.57 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  23.93 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  24.69 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  26.09 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  24.68 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  24.9 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  21.16 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  25.93 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  23.76 
 
 		 383 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  21.48 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  23.91 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  26.7 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  25.08 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.66 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  28.57 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  24.07 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  25.21 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  26.8 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  26.8 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  25.99 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  22.02 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  25.1 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  27.43 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  27.46 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  26.07 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  22.89 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  21.67 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  22.3 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  27.88 
 
 		 642 aa  57  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  24.8 
 
 		 385 aa  57  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  27.88 
 
 		 642 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  23.69 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  30.94 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  24.74 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  22.35 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  27.21 
 
 		 386 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  28.83 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  20.22 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  21.64 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  20.78 
 
 		 398 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  25.26 
 
 		 384 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  23.94 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  23.03 
 
 		 304 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  22.92 
 
 		 394 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>