43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4432 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  100 
 
 		 304 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  32.7 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  29.13 
 
 		 417 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  31.97 
 
 		 394 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  30.48 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  31.25 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  31.47 
 
 		 394 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  28.39 
 
 		 398 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  34.49 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  30.65 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  31.12 
 
 		 394 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  31.12 
 
 		 394 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  30.84 
 
 		 414 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  32.8 
 
 		 409 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  35.4 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  34.36 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  33.92 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  38.11 
 
 		 344 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  35.31 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  34.84 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  30.42 
 
 		 352 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  33.45 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  36.08 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  30.36 
 
 		 422 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  26.7 
 
 		 458 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  29.96 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  29.28 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  31.38 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  25.69 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  28.18 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  30.16 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  26.32 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  34.1 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  30.05 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  27.72 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  27.67 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  31.01 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  29.63 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  24.43 
 
 		 456 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  23.03 
 
 		 472 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  33.67 
 
 		 410 aa  47  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  31.54 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>