61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0226 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  837    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  43.88 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  40.88 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  35.25 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  38.95 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  36.94 
 
 		 413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  39.89 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  39.57 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  39.57 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  35.34 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  34.59 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  34.62 
 
 		 392 aa  217  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  37.09 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  35.94 
 
 		 436 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  31.95 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  35.41 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  35.51 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  31.69 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  33.42 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  31.71 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  32.57 
 
 		 458 aa  170  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  31.27 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  30.67 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  29.56 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  33.8 
 
 		 253 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  29.71 
 
 		 346 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  26.57 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  26.75 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  26.37 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  22.29 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  27.07 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  24.54 
 
 		 358 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  23.03 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  27.73 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  23.76 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  25.51 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  25.48 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  22.89 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  24.54 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  27 
 
 		 353 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  21.93 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  22.16 
 
 		 484 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  23.93 
 
 		 493 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  26.51 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  24.3 
 
 		 624 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  24.83 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  30.28 
 
 		 624 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  27.36 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  20.96 
 
 		 478 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  22.11 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  22.11 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  21.99 
 
 		 494 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  21.18 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  25.96 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  25.96 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  25.96 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  23.81 
 
 		 593 aa  43.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  25.26 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  20 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>