36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0022 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  81.45 
 
 		 318 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  80.19 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  70.35 
 
 		 321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  53.9 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  54.29 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  48.54 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  36.54 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  27.06 
 
 		 392 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  36.58 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  35.31 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  25.74 
 
 		 398 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  23.27 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  23.28 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  26.89 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  25.32 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  27.21 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  26.89 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  26.2 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  25.24 
 
 		 414 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  25.09 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  23.89 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  29.49 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  24.48 
 
 		 458 aa  62.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  22.71 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  27.22 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  20.75 
 
 		 464 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  27.5 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  28.85 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  33.54 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  22.7 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  19.62 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  26.09 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  24.53 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  23.42 
 
 		 470 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>