91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0223 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 484 aa  982    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  59.69 
 
 		 593 aa  564  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  64.47 
 
 		 478 aa  562  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  60.53 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  59.56 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  61.92 
 
 		 451 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  59.27 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  61.61 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  56.25 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  59.5 
 
 		 451 aa  529  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  60.22 
 
 		 476 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  56.46 
 
 		 603 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  53.16 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  51.43 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  51.84 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  52.11 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  53.05 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  51.25 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  51.14 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  49.9 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  49.9 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  52.03 
 
 		 482 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  49.9 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  48.39 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  53.81 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  47.88 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  44.74 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  50.12 
 
 		 451 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  46.47 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  45.39 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  46.24 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  45.62 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  42.73 
 
 		 448 aa  362  9e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  43.75 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  42.66 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  44.95 
 
 		 456 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  39.74 
 
 		 472 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  41.53 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  41.45 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  34.14 
 
 		 674 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  25.74 
 
 		 666 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25.42 
 
 		 393 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.39 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  27.94 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  29 
 
 		 642 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  24.34 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  22.87 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  28.64 
 
 		 642 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  24.03 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  23 
 
 		 383 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  22.25 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  23.1 
 
 		 406 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  23.74 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  22.58 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  22.78 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  24.36 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.78 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  22.57 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  26.18 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.38 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  21.26 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  23.19 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.98 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  25.22 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  23.84 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  24.24 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  24.47 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  22.7 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  26.73 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  22.67 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  23.85 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  21.91 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  26.32 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  22.34 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  23.38 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  22.33 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  22.41 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  21.94 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  23.49 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  25.6 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  21.64 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  21.85 
 
 		 384 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  21.64 
 
 		 389 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  21.7 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  20.74 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  25.14 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  20.5 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  23.26 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  22.07 
 
 		 388 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>