76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4429 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 466 aa  931    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  61.57 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  63.02 
 
 		 454 aa  542  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  56.03 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  55.48 
 
 		 486 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  59.11 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  56.67 
 
 		 476 aa  475  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  56.73 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  56.59 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  51.43 
 
 		 484 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  52.3 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  51.49 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  52.3 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  52.52 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  52.4 
 
 		 454 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  50.91 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  51.09 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  51.69 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  49.43 
 
 		 593 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  51.05 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  49.68 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  50.35 
 
 		 466 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  49.34 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  53.38 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  48.64 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  51.78 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  47.17 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  48.74 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  48.51 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  48.74 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  49.53 
 
 		 603 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  48.49 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  50.12 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  51.43 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  44.9 
 
 		 624 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  45.12 
 
 		 624 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  44.44 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  42.19 
 
 		 472 aa  326  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  42.18 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  38.85 
 
 		 674 aa  259  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  29.3 
 
 		 666 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25.19 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.5 
 
 		 448 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  24.43 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.52 
 
 		 453 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  28.46 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  25.32 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  24.28 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.6 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  24.74 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  29.24 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.63 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  25.06 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  24.16 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  23.64 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.17 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  21.68 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  23.57 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.77 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  22.54 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  22.51 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  23.76 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  22.39 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  21.73 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  23.55 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.52 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  21.07 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  21.65 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  24.33 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  21.39 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  23.35 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  20.06 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  21.12 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  21.25 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  21.93 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  21.67 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>