79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0274 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 384 aa  769    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  62.4 
 
 		 383 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  59.95 
 
 		 389 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  62.92 
 
 		 386 aa  482  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  59.38 
 
 		 385 aa  481  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  61.72 
 
 		 384 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  61.88 
 
 		 385 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  58.22 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  57.96 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  56.36 
 
 		 389 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  57.44 
 
 		 387 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  57.55 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  56.28 
 
 		 383 aa  428  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  59.06 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  40.21 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  40.21 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  41.67 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  38.9 
 
 		 416 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  34.11 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  32.4 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  28.69 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  29.07 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.27 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  27.14 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  25.97 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  25.14 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  28.09 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  27.06 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  27.09 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  28.62 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  25.41 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  25.64 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.21 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  26.27 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.27 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  22.89 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  24.16 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.06 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.68 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  23.72 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  21.88 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  22.47 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.37 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  24.04 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  21.27 
 
 		 603 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  22.48 
 
 		 624 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  22.86 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  21.65 
 
 		 425 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  22.22 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  19.27 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  23.87 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  28.33 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.57 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  23.91 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  21.04 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  24.3 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  19.05 
 
 		 494 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  26.85 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  22.79 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  21.85 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  25.26 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  32.77 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.47 
 
 		 304 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  27.23 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  20.96 
 
 		 593 aa  47  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  19.95 
 
 		 445 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  21.74 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  23.4 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  22.6 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  21.99 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  23.34 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  20.72 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  21.67 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  22.28 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  22.67 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  21.52 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  27.03 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  20.75 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>