83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1664 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 
425 aa  833    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  61.11 
 
 
414 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  50.13 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  43.42 
 
 
397 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1962  polysulphide reductase, NrfD  43.67 
 
 
416 aa  222  9e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25.96 
 
 
393 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  30.94 
 
 
389 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  29.29 
 
 
384 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  27.42 
 
 
413 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  29.62 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  24.67 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  29.49 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  23.66 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.42 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  26.46 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  26.14 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25.16 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  23.9 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  26.82 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  27.07 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  23.28 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.62 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.46 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  23.76 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.97 
 
 
391 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  25.78 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  25.51 
 
 
393 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  24.02 
 
 
413 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  22.79 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  24.87 
 
 
397 aa  61.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  25.11 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  24.31 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  23.42 
 
 
385 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  22.35 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  22.42 
 
 
384 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  22.19 
 
 
419 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.95 
 
 
383 aa  57  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  25.44 
 
 
403 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  25.52 
 
 
386 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  25.4 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  21.31 
 
 
387 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  23.75 
 
 
383 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  24.65 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  28.76 
 
 
304 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  24.63 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 
315 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  22.97 
 
 
417 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  22.01 
 
 
411 aa  53.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  27.44 
 
 
448 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  23.66 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  25.74 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  24.16 
 
 
413 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  24.91 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  28.12 
 
 
483 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  21.61 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  24.15 
 
 
418 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  22.96 
 
 
403 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  24.16 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  21.98 
 
 
403 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  25.56 
 
 
305 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  27.08 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  22.67 
 
 
389 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  22.53 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  24.45 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  24.23 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  25.56 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.19 
 
 
531 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  22.62 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  20.25 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  23.92 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  25.36 
 
 
315 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  24.21 
 
 
414 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  24.4 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  24.91 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  23 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  24.33 
 
 
417 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  24.23 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  24.2 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0353  polysulphide reductase, NrfD  26.89 
 
 
315 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 
318 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0493  polysulphide reductase, NrfD  23.55 
 
 
315 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  23.81 
 
 
410 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>