104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4229 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 386 aa  756    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  73.83 
 
 		 389 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  31.15 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  31.55 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  28.81 
 
 		 408 aa  139  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  28.85 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  29.83 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  30.41 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  29.4 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  28.53 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  29.75 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  29.81 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  27.07 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  26.6 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  29.02 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  27.71 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  25.74 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  27.64 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  25.64 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  24.49 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  24.53 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  26.86 
 
 		 383 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  27.78 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  27.64 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  27.01 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  25.21 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  24.79 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  26.51 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  25.77 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  25.76 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  25.48 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.85 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  26.35 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  25.21 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  25.49 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  24.31 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  26.95 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  26.33 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  23.61 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  25.76 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  26.42 
 
 		 453 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  26.67 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  24.64 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  24.63 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  27.16 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  24.74 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  26.87 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  22.59 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  24.09 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  23.94 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4090  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.61 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  26.11 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  23.39 
 
 		 624 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  29.87 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  26.53 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  26.39 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  24.28 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  23.85 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  26.18 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  23.26 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  24.31 
 
 		 593 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  26.02 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  24.22 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  25.73 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  22.71 
 
 		 624 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  23.24 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  24.64 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3972  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.21 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  23.36 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  23.92 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 417 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  26.34 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  24.25 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  24.13 
 
 		 490 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  24.21 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  24.76 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  24.76 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  25.24 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  32.79 
 
 		 288 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  24.46 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0355  polysulphide reductase, NrfD  26.32 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  22.02 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  23.27 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 		 603 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  29.77 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  22.39 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  24.14 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  35.24 
 
 		 288 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1116  polysulphide reductase, NrfD  25.86 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  23.69 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  24.87 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  25.53 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  23.26 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  23.72 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  21.46 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  23.97 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  22.59 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  23.2 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  27.71 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  27.48 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>