76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3188 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
413 aa  817    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  99.76 
 
 
413 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  97.68 
 
 
414 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  70.32 
 
 
405 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  39.56 
 
 
415 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  40.69 
 
 
412 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  40.45 
 
 
412 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  39.36 
 
 
417 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  40.73 
 
 
417 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0070  oxidoreductase, membrane subunit  40.54 
 
 
417 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  35.82 
 
 
391 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  29.85 
 
 
400 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  26.17 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  29.97 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  23.01 
 
 
394 aa  77  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  27.43 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  27.03 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  23.65 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  23.98 
 
 
414 aa  61.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  20.49 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  22.64 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  23.25 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  26.13 
 
 
445 aa  57  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.96 
 
 
413 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  24.45 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  23.34 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  23.65 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  24.26 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  23.62 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  24.33 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  23.17 
 
 
305 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  24.4 
 
 
401 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  24.4 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  24.78 
 
 
313 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  25.91 
 
 
472 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4532  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.57 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  27.32 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  24.45 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.67 
 
 
318 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4625  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.57 
 
 
318 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4623  cytochrome c nitrite reductase NrfD subunit  27.57 
 
 
318 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  27.52 
 
 
318 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.52 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.790103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.52 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  27.52 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  27.52 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  27.52 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  27.52 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  27.52 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4674  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.57 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  27.52 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.51 
 
 
334 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.57 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  21.75 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  25.23 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  23.65 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  22.82 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  27.39 
 
 
323 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  26.32 
 
 
318 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  27.95 
 
 
448 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  22.63 
 
 
387 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  27.83 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  28.77 
 
 
472 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  29.11 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0658  Polysulphide reductase NrfD  28.91 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.245596  hitchhiker  0.00748855 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  24.48 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  25.45 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  23.96 
 
 
393 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  35.8 
 
 
288 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  22.12 
 
 
397 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.15 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.12 
 
 
320 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  23.87 
 
 
477 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3178  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  23.53 
 
 
318 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  24.76 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>