131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3249 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  100 
 
 
318 aa  620  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3178  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  88.99 
 
 
318 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1032  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  61.85 
 
 
320 aa  339  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0798  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  62.73 
 
 
320 aa  318  9e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  49.38 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  49.69 
 
 
318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  45.28 
 
 
323 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  49.38 
 
 
318 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.790103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  49.38 
 
 
318 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  49.38 
 
 
318 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  49.38 
 
 
318 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  49.38 
 
 
318 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  49.38 
 
 
318 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  45.28 
 
 
323 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  47.65 
 
 
320 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  48.43 
 
 
320 aa  278  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  48.75 
 
 
318 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  45.91 
 
 
313 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  48.26 
 
 
318 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  44.34 
 
 
318 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  44.62 
 
 
313 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  44.16 
 
 
313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4625  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  48.9 
 
 
318 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4532  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  48.9 
 
 
318 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4674  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  48.9 
 
 
318 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4623  cytochrome c nitrite reductase NrfD subunit  48.59 
 
 
318 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  42.72 
 
 
313 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0183  polysulphide reductase, NrfD  44.34 
 
 
313 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4151  polysulphide reductase NrfD  44.34 
 
 
313 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0184  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  44.34 
 
 
313 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  42.45 
 
 
313 aa  255  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4283  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  44.03 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0315  polysulphide reductase, NrfD  43.4 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3835  polysulphide reductase, NrfD  44.16 
 
 
313 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3762  polysulphide reductase, NrfD  44.16 
 
 
313 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0242  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  40.88 
 
 
313 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3960  polysulphide reductase, NrfD  43.85 
 
 
313 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1367  Polysulphide reductase NrfD  48.61 
 
 
317 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  43.67 
 
 
316 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3158  polysulphide reductase, NrfD  44.94 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2904  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  44.62 
 
 
313 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.554109  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  36.54 
 
 
313 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  35.26 
 
 
314 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  39.34 
 
 
321 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  35.26 
 
 
314 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  35.58 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  35.02 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  35.26 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  36.83 
 
 
315 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  35.56 
 
 
315 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  35.56 
 
 
315 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  34.5 
 
 
315 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  35.46 
 
 
315 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  35.46 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  33.23 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  35.81 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  33.96 
 
 
323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4472  polysulphide reductase NrfD  34.08 
 
 
315 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0484  polysulphide reductase NrfD  35.99 
 
 
315 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3872  polysulphide reductase NrfD  34.52 
 
 
315 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  34.19 
 
 
311 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0271  Polysulphide reductase NrfD  35.51 
 
 
322 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  34.73 
 
 
315 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  32.29 
 
 
309 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  33.54 
 
 
315 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3175  polysulfide reductase, subunit C  32.52 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0494  polysulphide reductase, NrfD  33.55 
 
 
315 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0508  polysulphide reductase NrfD  34.39 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0493  polysulphide reductase, NrfD  34.41 
 
 
315 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4451  polysulphide reductase NrfD  34.29 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  34.05 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  31.86 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0487  polysulphide reductase, NrfD  34.52 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0353  polysulphide reductase, NrfD  33.33 
 
 
315 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  33.23 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  33.02 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  28.66 
 
 
288 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  28.48 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  29.87 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  26.84 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.35 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  29.91 
 
 
347 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  28.57 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.62 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  26.96 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3984  polysulphide reductase, NrfD  23.03 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  26.56 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  26.3 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2917  Polysulphide reductase NrfD  27.04 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0309  Polysulphide reductase NrfD  27.59 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000856639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  24 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  24.77 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3245  polysulphide reductase, NrfD  27.02 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  27.61 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  26.87 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  25.23 
 
 
400 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  27.48 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  27.36 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  31.16 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  24.92 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>