48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0864 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  80.72 
 
 		 412 aa  683    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  78.42 
 
 		 417 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  80.96 
 
 		 412 aa  682    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 415 aa  842    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0070  oxidoreductase, membrane subunit  78.18 
 
 		 417 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  76.02 
 
 		 417 aa  624  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  41.18 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  40.29 
 
 		 414 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  39.56 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  39.56 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  34 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  28.61 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  26.24 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  26.74 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  27.18 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  21.91 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  23.01 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  21.94 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  23.65 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  26.19 
 
 		 305 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  25.27 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  24.02 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.5 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  23.81 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  21.31 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  24.29 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.34 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.95 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  21.15 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  23.08 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  26.15 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  22.16 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  24.37 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  21.98 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  21.89 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.37 
 
 		 320 aa  46.6  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  22.48 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  24.75 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  28.99 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  25 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  21.63 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  29.38 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  24.07 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  24.38 
 
 		 324 aa  43.1  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  21.99 
 
 		 311 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.96 
 
 		 334 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  21.35 
 
 		 323 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  23.08 
 
 		 318 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>