79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1740 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  100 
 
 		 361 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  35.8 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  37.01 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  36.08 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  36.54 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  36.83 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  36.16 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  35.33 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  37.43 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  37.43 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  37.43 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  37.16 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  37.16 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  37.07 
 
 		 391 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  36.06 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  33.33 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  36.06 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  33.24 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  35.92 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  37.71 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  26.6 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.4 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  27.6 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  25.55 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  32.61 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  26.03 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  26.58 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  25.27 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  25.14 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  27.06 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  25.5 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  27.06 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  27.06 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  28.81 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  24.41 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  26.73 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  31.43 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2604  polysulphide reductase, NrfD  29.57 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0070  oxidoreductase, membrane subunit  26.76 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  27.43 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  29.32 
 
 		 304 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  25.54 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  28.33 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  27.93 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  24.75 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  25 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  23.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  27.23 
 
 		 304 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  24.38 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  29.53 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  28.48 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  23.33 
 
 		 386 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.84 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  23.73 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  23.83 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  30.09 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25.89 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  27.19 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  24.11 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  29.44 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0658  Polysulphide reductase NrfD  29.67 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.245596  hitchhiker  0.00748855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  23.68 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  28.23 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  27.91 
 
 		 361 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  30.04 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0386  Polysulphide reductase NrfD  30.11 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  22.44 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  24.76 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  28.27 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  34.65 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  29.27 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  26.67 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  27.84 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  28.16 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3175  polysulfide reductase, subunit C  28.02 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  28.19 
 
 		 315 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  30.85 
 
 		 321 aa  43.1  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>