76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0102 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  92.37 
 
 		 393 aa  726    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  100 
 
 		 393 aa  771    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  93.89 
 
 		 393 aa  735    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  33.93 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  23.91 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  25.26 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  25.35 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  25.64 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  27.14 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  23.31 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  24.16 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  25.77 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  26.87 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  25.54 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  23.39 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  23.66 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  25.58 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  23.51 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.71 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  26.12 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  22.9 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  21.91 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  25.47 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  24.29 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.97 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  22.97 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.2 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  23.01 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  20.76 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  21.64 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  22.78 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  23.01 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  22.49 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  24.19 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  22.75 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  19.68 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0070  oxidoreductase, membrane subunit  22.07 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  22.34 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  22.96 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  24.23 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  28.67 
 
 		 321 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  20.44 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  25.74 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  23.08 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  23.44 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  26.73 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  25.3 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  22.01 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  25.59 
 
 		 288 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  22.44 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  21.89 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  21.95 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  25.29 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  22.56 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  21.78 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  24.57 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  22.42 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  24.57 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.57 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  21.85 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  24.57 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  24.57 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  24.76 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  23.96 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  19.93 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  24.57 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  23.78 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  24.82 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  21.89 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  26.67 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.22 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.790103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  23.84 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  21 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  26.27 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>