149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  100 
 
 		 384 aa  757    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  70.87 
 
 		 389 aa  534  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  60.78 
 
 		 406 aa  411  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  55.32 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  53.85 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  56.32 
 
 		 388 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  54.4 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  39.67 
 
 		 408 aa  229  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  43.17 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  35.2 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  34.47 
 
 		 413 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  32.92 
 
 		 414 aa  169  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  31.59 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  33.22 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  29.09 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  30.38 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  27.13 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  30.07 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  29.84 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  30.11 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  28.35 
 
 		 384 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  29.38 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  29.64 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  25.97 
 
 		 384 aa  122  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  27.42 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  25.82 
 
 		 387 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  27.03 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  28.46 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  26.79 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  29.19 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  27.59 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  26.03 
 
 		 624 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  27.01 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  25.57 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  27.91 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  26.3 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  25.8 
 
 		 624 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  27.79 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  26.3 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  28.21 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.6 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  27.6 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  24.84 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  24.84 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  26.53 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  24.09 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.96 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  25.77 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  24.3 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  26.79 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  29.13 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.51 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  25.56 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  24.31 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  23.93 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  24.16 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  25.33 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  27.35 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  24.93 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.35 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  24.16 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  21.73 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  25.26 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  24.93 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  25 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  24.53 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  21.51 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  22.88 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  25.18 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  22.04 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  23.9 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  22.45 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  23.6 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  24.11 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  24.52 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  23.9 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  27.88 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  24.8 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  24.17 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.46 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  22.84 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  23.99 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  23.64 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  23.74 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  30.66 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  22.75 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  23.43 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  27.8 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  21.41 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  21.19 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  22.82 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  25.98 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  22.05 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  21.2 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  25.98 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  21.93 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  21.93 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  26.29 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  22.48 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>