49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3520 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0070  oxidoreductase, membrane subunit  85.85 
 
 		 417 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  75.54 
 
 		 412 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  75.06 
 
 		 412 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 417 aa  843    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  78.42 
 
 		 415 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  70.74 
 
 		 417 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  41.93 
 
 		 405 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  39.12 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  39.12 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  39.36 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  33.14 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  29.68 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  25.97 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25.92 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  25.61 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  25.55 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  29.05 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  24.14 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  22.97 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  24.15 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  22.95 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  26.42 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  23.67 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  22.13 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  21.96 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  25.25 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  26.4 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  23.18 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  21.73 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.62 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  23.08 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  23.71 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  24.93 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  26.39 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  23.1 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.23 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  23.59 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  23.35 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  26.27 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  24.11 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  23.45 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  24.88 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  23.04 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  22.16 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  24.66 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  22.73 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.62 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1021  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 		 512 aa  43.1  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.539735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>