75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3088 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  94.23 
 
 		 413 aa  718    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  93.99 
 
 		 413 aa  715    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 414 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  70.05 
 
 		 405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  40.79 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  41.69 
 
 		 412 aa  299  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  41.69 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  39.85 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  40.98 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0070  oxidoreductase, membrane subunit  41.03 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  35.55 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  29.21 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  27.76 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  30.61 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  27.43 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  26.61 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  25.31 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  23.7 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  22.64 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  20.49 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  24.52 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  25.89 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  24.59 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  23.95 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  24.28 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  23.19 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  23.41 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  25.18 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  22.72 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  27.32 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  24.5 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  24.78 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  25.62 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  25.45 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.51 
 
 		 334 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4532  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.64 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  27.06 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  23.4 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  27.06 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.56 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.06 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  29.17 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  27.06 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  27.06 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  27.06 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.06 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.790103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  27.06 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  27.06 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4625  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.1 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4623  cytochrome c nitrite reductase NrfD subunit  27.1 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  24.22 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4674  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.1 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  24.77 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.64 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  29.58 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  24.03 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  23.51 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  23.46 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  26.52 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  25.88 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  29.27 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  26.96 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  28.5 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  28.1 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.15 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  35.8 
 
 		 288 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  28.17 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0658  Polysulphide reductase NrfD  28.44 
 
 		 330 aa  43.5  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.245596  hitchhiker  0.00748855 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  23.44 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  24.76 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  24.24 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>