81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5954 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 445 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  49.55 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  48.83 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  51.39 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  52 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  50.9 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  48.61 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  44.82 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  50 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  48.56 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  49.32 
 
 		 482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  47.5 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  47.5 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  46.19 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  46.82 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  47.36 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  47.09 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  47.78 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  44.74 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  42.89 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  40.72 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  44.57 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  40.47 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  43.38 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  46.21 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  42.38 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  41.93 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  42.79 
 
 		 476 aa  359  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  41.93 
 
 		 456 aa  359  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  46.26 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  42.63 
 
 		 603 aa  357  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  41.42 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  38.99 
 
 		 451 aa  339  5e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  44.09 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  43.89 
 
 		 624 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  43.39 
 
 		 624 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  37.92 
 
 		 472 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  40.05 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  41.2 
 
 		 674 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  39.63 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  28.1 
 
 		 666 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  23.02 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.95 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  24.11 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  25.62 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  31.55 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  31.55 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  22.74 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  21.96 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  27.31 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  24.37 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  23.6 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  22.75 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  23.49 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  22.39 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  20.2 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.01 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  27.32 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  21.43 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  20.83 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  22.05 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  20.33 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  21.06 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  21.23 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  21.77 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  22.78 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  21.46 
 
 		 389 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  24.07 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  21.59 
 
 		 387 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  22.6 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  24.93 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.67 
 
 		 729 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  21.97 
 
 		 387 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  20.09 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  20.74 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  18.23 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  20.1 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  20.93 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  20.74 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2532  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  27.43 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  23.04 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>