71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0834 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 448 aa  878    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  47.85 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  48.95 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  48.64 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  48.2 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  48.61 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  47.15 
 
 		 463 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  45.87 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  49.27 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  46.83 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  46.15 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  47.72 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  45.35 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  45.8 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  43.31 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  43.79 
 
 		 482 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  44.17 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  41.65 
 
 		 490 aa  356  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  41.96 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  46.11 
 
 		 478 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  45.85 
 
 		 478 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  45.85 
 
 		 478 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  42.95 
 
 		 477 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  42.76 
 
 		 494 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  42.73 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  41.85 
 
 		 466 aa  342  9e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  41.12 
 
 		 593 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  47.92 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  43.31 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  43.29 
 
 		 456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  43.53 
 
 		 456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  45.81 
 
 		 461 aa  336  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  43.76 
 
 		 603 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  44.62 
 
 		 430 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  37.3 
 
 		 456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  38.33 
 
 		 448 aa  279  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  37.3 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  39.6 
 
 		 624 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  39.36 
 
 		 624 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  40.79 
 
 		 674 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  30.82 
 
 		 666 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25.53 
 
 		 393 aa  93.6  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  29.29 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  23.5 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  25.2 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  35.11 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  25.57 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  29.78 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.85 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  25.27 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  23.54 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  28.28 
 
 		 642 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  28.99 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  36.94 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  21.77 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  24.29 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  31.51 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.41 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  31.43 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  24.57 
 
 		 445 aa  53.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  22.45 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  20.2 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  21.48 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.89 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  22.35 
 
 		 388 aa  46.6  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0355  polysulphide reductase, NrfD  25.21 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  20.5 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  23.61 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  26.97 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  21.34 
 
 		 385 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  20.65 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>