108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1812 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 456 aa  920    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  80.54 
 
 		 472 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  45.91 
 
 		 624 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  45.26 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  45.45 
 
 		 624 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  44.27 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  42.55 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  43.96 
 
 		 472 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  41.56 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  41.56 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  39.39 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  42.89 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  41.97 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  44.44 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  43.54 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  43.09 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  41.79 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  41.71 
 
 		 593 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  43.58 
 
 		 454 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  43.07 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  41.54 
 
 		 456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  42.71 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  43.48 
 
 		 603 aa  318  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  41.46 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  40.65 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  41.55 
 
 		 451 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  43.6 
 
 		 486 aa  313  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  39.91 
 
 		 463 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  38.83 
 
 		 468 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  43.24 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  37.04 
 
 		 490 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  41.53 
 
 		 484 aa  309  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  37.89 
 
 		 451 aa  302  9e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  38.76 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  43.15 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  37.3 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  40.05 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  38.39 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  36.12 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  32.65 
 
 		 674 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  26.1 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  26.61 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  25.99 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  26.44 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  27.64 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  24.03 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.83 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  26.29 
 
 		 388 aa  87.8  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.76 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  25.71 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  23.63 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  22.85 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  23.36 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  24.59 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  23.4 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  27.49 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  24.45 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  21.87 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.88 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  25.71 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  24.57 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  22.82 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  22.62 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  25.31 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  23.4 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  26.27 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  23.75 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  28.1 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  26.59 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  21.9 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  26.01 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.06 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  23.9 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  21.55 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  25.32 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  22.59 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.22 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  23.87 
 
 		 384 aa  53.5  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  22.75 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  21.28 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  22.84 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  22.59 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  26.64 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  27.03 
 
 		 455 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  24.43 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  25.91 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  23.2 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  22.16 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  26.97 
 
 		 389 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  24.49 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  26.39 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  24.49 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  19.77 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  22.07 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  27.21 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  26.98 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  24.1 
 
 		 642 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>