152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2403 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 406 aa  797    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  63.93 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  61.32 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  60.78 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  60.69 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  54.99 
 
 		 393 aa  401  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  54.59 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  43.61 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  36.76 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  44.44 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  30.91 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  31.37 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  28.36 
 
 		 389 aa  147  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  28.26 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  28.72 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  27.97 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  28.02 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  31.28 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  28.35 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  30.15 
 
 		 387 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  27.64 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  29.41 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  28.1 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  29.12 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  28.62 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  24.73 
 
 		 624 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  25.63 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25.64 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  23.82 
 
 		 624 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  26.05 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  29.36 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  25.51 
 
 		 417 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  26.43 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  34.18 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  28.15 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  27.73 
 
 		 425 aa  99.8  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  24.36 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  30.68 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  24.56 
 
 		 416 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  28.24 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  24.81 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.05 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  26.92 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  22.56 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  22.48 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  27.75 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  22.14 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.52 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  22.03 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  26.95 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  25.36 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  27.87 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  24.65 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  23.65 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.74 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  21.59 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  23.89 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  23.63 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  24.42 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  23.58 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  24.5 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  23.22 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  24.93 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  21.23 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  22.25 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  24.81 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  25.32 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  22.32 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  23.1 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  32.21 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  25.32 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  23.68 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  22.39 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  25.06 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  22.51 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  20.37 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  24.1 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  25.25 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  21.59 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  27.99 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  27.06 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  23.51 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  26 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  22.6 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  21.97 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  22.07 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  24.51 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  21.1 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0160  polysulphide reductase, NrfD  24.94 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  21.43 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  23.12 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  25.5 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  22.59 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  22.86 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  24.76 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0698  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.04 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3281  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.04 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>