219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4782 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 400 aa  804    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  33.08 
 
 		 348 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  38.08 
 
 		 391 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  34 
 
 		 415 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  33.14 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  35.31 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  35.03 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  29.7 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  34.02 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0070  oxidoreductase, membrane subunit  33 
 
 		 417 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  30 
 
 		 413 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  30.42 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  29.37 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  30.64 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  27.5 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  27.95 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  26.5 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  28.17 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  25.91 
 
 		 411 aa  96.3  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  25.38 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  27.33 
 
 		 442 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  28.09 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  29.52 
 
 		 305 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.99 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  25.65 
 
 		 361 aa  86.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  27.83 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  27.49 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.02 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  22.99 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  25.39 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  27.08 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  25.07 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  27.46 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  26.94 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  27.92 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  23.23 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  21.16 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  27.92 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  27.3 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  29 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  23.82 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  26.83 
 
 		 288 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  27.33 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  25.08 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  28.34 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  28.34 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  22.04 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  22.9 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  26.69 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  23.55 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  21.88 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  26.48 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  26.38 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.38 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  22.64 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  22.76 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  26.38 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  22.55 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  26.57 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  26.38 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  26.38 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  25.54 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  25.15 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  22.43 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  21.64 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  23.95 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  26.07 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2172  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653365  hitchhiker  0.000000233561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  26.63 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.07 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.790103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  26.07 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  22.01 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  25.51 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  25.29 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.69 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  23.91 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  26.44 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  27.33 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.23 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  24.66 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  26.29 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3178  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.79 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  24.68 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  23.84 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  25.66 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  21.55 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  23.42 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  26.99 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1367  Polysulphide reductase NrfD  26.17 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.94 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  23.5 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.23 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  25.3 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  24.92 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  24.69 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  27.23 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  24.92 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  24.03 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>