76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1709 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 397 aa  800    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  47.01 
 
 		 414 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  43.43 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  44.19 
 
 		 400 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1962  polysulphide reductase, NrfD  34.4 
 
 		 416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  29.29 
 
 		 413 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  28.43 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  26.29 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  26.42 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  27.53 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  24.8 
 
 		 442 aa  90.1  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  28.57 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.2 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  25.3 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.6 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  26.8 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  26.68 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  27.57 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  26.85 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  24.93 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  24.94 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  27.65 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  21.43 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  25.67 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  25.91 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  29.09 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  24.9 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  21.88 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  23.83 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  23.23 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  25.58 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  25.86 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  25.52 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.84 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.74 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  21.21 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  22.69 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  24.56 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.46 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  24.18 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  20.76 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  23.49 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  22.03 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  24.04 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  29.93 
 
 		 304 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  22.51 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  22.53 
 
 		 378 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  24.24 
 
 		 624 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  22 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  23.89 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  20.7 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  25.08 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  23.01 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  19.48 
 
 		 315 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0493  polysulphide reductase, NrfD  21.1 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  22.12 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  21.57 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  21.14 
 
 		 314 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3872  polysulphide reductase NrfD  21.57 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  26.4 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  21.77 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  20.78 
 
 		 315 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  23.19 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  29.93 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3175  polysulfide reductase, subunit C  21.97 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0494  polysulphide reductase, NrfD  21.1 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  25 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  25.42 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  23.35 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  25.23 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  24.32 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1637  Polysulphide reductase NrfD  23.27 
 
 		 285 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000405044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  28.08 
 
 		 288 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0487  polysulphide reductase, NrfD  22.68 
 
 		 315 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>