60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2474 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  100 
 
 		 400 aa  788    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  61.89 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  52.53 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  44.19 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1962  polysulphide reductase, NrfD  35.86 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  29.21 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  28.84 
 
 		 393 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  29.53 
 
 		 411 aa  93.6  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  30.26 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  25.19 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  25.2 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  27.76 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  26.49 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  25.68 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  25.86 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  23.47 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  24.81 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  24.15 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  28.87 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  24.22 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  26.24 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  22.48 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  24.3 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  27.05 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  21.33 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  24.24 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  24.08 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  23.1 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  23.27 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.19 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  24.43 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  23.68 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  22.82 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  21.91 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  22.82 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  21.94 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  25.25 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.69 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  26.92 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  27.33 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  28.19 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  22.4 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  22.13 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  21.61 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  22.4 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0355  polysulphide reductase, NrfD  24.81 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  22.33 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  24.22 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  22.19 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  24.84 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  26.82 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  23.77 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  24.28 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  24.22 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  27.17 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  24.37 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  21.7 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>