96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0239 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 386 aa  771    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  67.62 
 
 		 387 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  65.28 
 
 		 387 aa  524  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  64.49 
 
 		 383 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  66.41 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  65.45 
 
 		 389 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  62.92 
 
 		 384 aa  498  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  62.24 
 
 		 385 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  59.38 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  61.82 
 
 		 385 aa  475  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  58.9 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  56.02 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  55.26 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  54.71 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  43.01 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  40.68 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  40.68 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  39.43 
 
 		 416 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  34.81 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  35.04 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  29.07 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  30.06 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  29.4 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  29.91 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  28.53 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.57 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  28.46 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  27.7 
 
 		 411 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  28.74 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  36.09 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  27.23 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  26.04 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  30.68 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.32 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  27.64 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  24.46 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  25.91 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.12 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  24.15 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.72 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  24.81 
 
 		 624 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  28.11 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  24.9 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  22.39 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  34.17 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  25.2 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  22.5 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  23.51 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  24.19 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  24.19 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  24.12 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  23.81 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  26.33 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  22.25 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  22.43 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  23.49 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  24.16 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  23.81 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  23.13 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  23.99 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  22.65 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  25.1 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  25.1 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  23.3 
 
 		 456 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  27.94 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  24.14 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  22.98 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  25.41 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.7 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  21.13 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  22.06 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  21.04 
 
 		 494 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  27.72 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  22.95 
 
 		 361 aa  49.7  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  23.23 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  20.36 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  26.73 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  26.73 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  24.15 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  25.79 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  22.25 
 
 		 603 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  21.08 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  22.5 
 
 		 486 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  25.36 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  23.83 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  21.61 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  20.81 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  24.1 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  21.53 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  25.23 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  24.86 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  20.45 
 
 		 454 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  21.88 
 
 		 451 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  31.18 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  22.93 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  23.46 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>